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				**				GUIDE LIGNE 			       **
				**                                                                     **	
				**	pour l'intégration d'outils dans l'instance Galaxy 	       **
				**                                                                     **
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+            CAS 1 : RECUPERATION D'UN OUTIL GALAXY EXISTANT DANS UN TOOL SHED 		+
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Voici les informations à fournir sur l'outil à installer :
- Intitulé exact de l'outil
- Sa version et date de création
- Auteur
- Lien URL (si possible) ou nom du Tool Shed (international, local, IFB , autre ?).
- Thématique / section correspondante dans Galaxy.


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+            CAS 2 : INTEGRATION D'UN SCRIPT (maison ou pas)                            +
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Voici les informations à fournir sur le script à installer :

- Si le script fait appel à des outils bioinfo, veuillez préciser lesquels ainsi que leur version.

- Exemple de ligne de commande avec l'ensemble des options souhaitées et des paramètres.

- Des fichiers de tests (les plus légers possibles).

- Liste détaillées des inputs et outputs avec, pour chaque fichier:
* Son format
* Son intitulé exact
* Si le fichier doit être ou pas récupérer par l'utilisateur Galaxy
* Si l'output sera ou pas réutilisé par un autre script ensuite
* Commentaires à destination des utilisateurs Galaxy: 
	. exemple d'utilisation, 
	. description détaillée des fichiers entrants et sortants, 
	. usage détaillé du script et autres informations qui vous semblent utiles.
	. Description détaillée des paramètres et des options.


- Si plusieurs scripts constituent un workflow, préciser :
* L'ordre des scripts.
* Les liens entre ces scripts (output de l'un = input de l'autre ?, vérifier aussi la compatibilité des formats).
* Fournir la documentation éventuelle.